施琅拿下台湾后，第一件事就是去郑成功庙拜祭。一是对郑氏父子功绩的高度肯定，二是表明自己的态度：攻打台湾并非为一己之私，而是为国家统一和百姓幸福着想。他的祭文这么说：“自从南安侯入台，台地始有居民……所以忠朝廷而报父兄之职分也……公义私恩，如是则已。”
当年，他再次降清，的确是私人原因，郑成功一名下属得罪他，他借故将人给砍了。他敢这么做是因为他是郑芝龙的手下，当年随着郑芝龙一块降了清。结果，这事惹恼了郑成功，不仅将他的父兄诛杀，还使他再次投靠了清廷。
当时，清廷对于台湾的态度很含糊，满人毕竟不了解中国的千年来历史，对于台湾的地位和战略意义没有任何概念。他们觉得这个地方太遥远，隔着那么一大片海域，太难管理了。但是，施琅心里却非常清楚，若是放弃台湾，就是将那一大片海域拱手让人，且带来的不仅仅是丧失海域治权问题，更多的则是军事上的被动。
当时，施琅有个有利条件，他的大舅哥潘湖叟黄锡衮是分管兵部的东阁大学士。所以，他的对台立场得到了大舅哥的力挺，使得大家对台湾的看法也渐渐更加理性，这才为后来收复、治理台湾奠定了基础。
而这时的台湾，也由于郑氏家庭矛盾，已经出现了人心散涣。
都知道，郑经的儿子郑克臧是私生子，这事当年闹的动静很大。本来，郑成功是想废了这个儿子，但当时郑经在厦门一带，他的手下都拥护他。据说，郑成功的英年早逝还和此事有关。此外，郑克臧很得郑经的喜欢，为人聪慧，做事很有章程，在郑经生病后，便是他来管理事务。
只是郑经还有一个儿子郑克塽，是正房所生，所以，他的岳父心中就有了想法。于是，在郑经去世后，就将郑克臧给毒死了，然后，拥立郑克塽。
那这时他多大呢?
11岁。
这个年龄就是被人拿捏在手中的傀儡。
此外，这个岳父做事不仅专断，还很贪，没谁愿意让这样的人领导自己，所以，大家的心就开始散了。
施琅一直密切关注台湾情况，他觉着这是个时机，且这时台湾又在对外用兵，于是，上奏朝廷赶紧将台湾收回。
不过，清廷派出的官员赴台招抚没有成功，所以，施琅便接二连三上奏朝廷，不能让对方有时间壮大自己。
此外，他还说：自古对于负隅抵抗的都是剿灭。并分析了台湾的兵力，人员不过2万，船兵大小不过200号，他们依仗的是大海。所以，在他看来，只要从福建水师和陆师等兵种中挑出精锐人员2万，就足以攻下台湾。他认为，对于台湾，不能一味招抚，还得武力配合，且越快解决越好。
不过，那时的康熙还没有完全掌握大权，鳌拜等人在朝廷有相当的话语权。所以，他们认为：海上打仗太难，哪天来阵大风，没准将船都刮没了。因为，这些满人没见识过海上作战，只会按照自己的幻想去界定。于是，施琅的这些用心良苦都被否决了，还将他的水师官职给抹了，让他待在北京宿卫，这时间就长达13年之久。
但是，施琅不会放弃，他相信自己会有被启用的一天，他每天做的事就是关注风潮信候。而这时，“三藩”之乱被平定，鳌拜这些人也被康熙剔除了朝堂。于是，朝廷中有大臣旧事重提，使施琅官复原位，为福建水师提督，这其实，就充分的表明了康熙的态度。
第二年，施琅率部攻克在澎湖的郑氏军队。此后，他一边制定下一步作战计划，一边开始招抚工作。
面对这种情况，郑克塽也明白，战与不战，结果都一样，还不如降了。
当施琅读完他的祭文后，郑氏官兵以及当地百姓无一不感动，能将大义和私人恩怨分的如此分明的，古今能有几人呢?若是施琅心中报仇之念占据主位的话，他应是对郑氏后人不会太手软，但是，他很清楚，国家利益永远第一。
康熙得到捷报后大喜，对施琅一顿封赏，在他去世后，还给其修祠纪念，后人也纷纷树碑赞扬他的事迹。因为，老百姓都清楚，若是台湾不平，这块地方就不会太平。于是，就很朴素地表达出了他们对施琅的褒赞，至今，这些碑坊让一代代人都记着他曾经的付出。
其实，评价施琅，更应站在一个历史高度去看他，若是纠结于他和郑氏的那些恩怨，只会让这具有时代意义的大事件变得黯淡。
因为，台湾一直就是中国的，以康熙的伟略作风来看，他迟早都会收复。
此外，在施琅任职台湾期间，清政府对于是否把台湾留在清朝版图上，更是产生了争执。其中的原因是：清朝对于海岛的管理没有经验，认为管理台湾是劳民伤财的事，但施琅却不这么认为。当时，他带着百姓筹措的资金，到京城一个个说服王公贵族，最终，让台湾留在了清朝的版图内。
由此可见，这件事才是施琅一生最大的功绩。
