在经过巫妖大战后，人族强势崛起，出现了无数惊才绝艳之辈，曾经统治天地的妖族和巫族在人族的强势打压之下，妖族四散逃逸，或是隐居起来，或是加入大势力门下，比如截教；而巫族却是迁居至东海之滨，重新开始繁衍。妖族已经彻底失去争霸天下之心，但巫族却是没有忘记曾经的辉煌，他们蛰伏着，并改名为九黎族（也或许巫族本来就叫九黎族），努力恢复实力。
但巫族人内心中的好斗之心并没有因为当年的灭世大战而磨灭，虽然实力远不如当初，但他们仍然互相内斗，所以一直无法和崛起的人族对抗，双方一时也是相安无事，这种情况一直持续到蚩尤出现。蚩尤不仅天赋极高，而且有理想有目标，在这种情况下，蚩尤修为增长极快，很快便成为巫族的第一强者。
而后蚩尤利用自己的智慧和实力开始了一统巫族的征程，巫族虽然好斗，但却是极为崇拜强者，所以蚩尤统一巫族并没有耗费太久的时间。统一巫族，只不过是蚩尤的第一个目标，他接下来的目标就是一统天下，最后便是一统三界，完成祖先未完成的事情。但当时人族实力经过伏羲、神农等人王的治理，已经非常强大，所以统一天下的任务也不是那么容易的。
不过蚩尤的运气也算不错，因为当时炎帝神农氏部落在辉煌了无数年后，已经开始没落了，所以在蚩尤率领麾下大军进攻炎帝部落时，炎帝部落简直没有任何抵抗能力，很轻易的就被蚩尤攻陷；剩下的炎帝部落人在首领的带领下投奔了黄帝部落；黄帝部落虽然只是一个新崛起的部落，但由于首领黄帝姬轩辕之故，所以此时的黄帝部落实力已经不下于炎帝部落。
虽然炎帝部落在之前与蚩尤的战役中损失惨重，但实力还是保存下来了相当大一部分，为了报仇，炎帝部落选择与黄帝部落合并，一时之间，黄帝部落（或者说炎黄部落）实力暴涨；但黄帝并没有因此而欣喜，因为他即将要面对曾经击溃炎帝部落的蚩尤了，从炎帝部落的人口中，黄帝已经知道蚩尤有多厉害了。
大战很快便爆发了，虽然黄帝部落实力暴增，但在面对蚩尤部落时，仍是力有不逮，屡战屡败；就在黄帝陷入绝境之时，他的师傅出现了，他的师傅就是后来阐教十二金仙之首的广成子；广成子实力极强，很快便挽回了部分局势，但没想到蚩尤的才华实在是太过惊人，竟然研究出秘术，以举族之力造十二都天神煞大阵，虽然威能不足当初的万分之一，但对抗广成子却是绰绰有余。
一时之间，人族局势又开始危急起来，但让人万万没想到的是，天庭突然插手了，昊天上帝派九天玄女去给黄帝赠天书，而且女娲娘娘也派部下给黄帝送来人族的至尊神器——轩辕剑；正是靠着天书和轩辕剑之力，黄帝最终赢了蚩尤。黄帝依靠师傅广成子、天庭以及人族至尊神器才勉强赢了蚩尤，可见蚩尤究竟有多厉害。
在大战之后，蚩尤被杀，但由于蚩尤实在太过强大，而且鉴于巫族秘法实在太诡异，黄帝不得不小心谨慎，于是就把蚩尤给分尸了，而且分别镇压在各个隐蔽之地。虽然黄帝如此对蚩尤，但内心对蚩尤还是很佩服的，不仅尊蚩尤为“兵主”，而且还将蚩尤的形象绘制在旗上。此战之后，天下皆服，黄帝成为真正的天下共主。
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