作为人类航海史上一个空前的壮举，郑和下西洋是中国人的骄傲。然而，郑和下西洋却留下了无数谜团，其中最根本的原因就在于：档案资料神秘失踪，让后人没办法了解这一辉煌历史，只能从史料和出土的文物中，看到一鳞半爪。
郑和下西洋的档案资料，究竟去了哪里？根据内库档案写成的《殊域周咨录》中记载了一段话，成为传统史学界的观点，即：刘大夏毁掉了郑和下西洋资料。
三保（即郑和）下西洋，费钱粮数千万，军民死且万计，纵得宝而回，于国家何益！此特一弊政，大臣所当谏也。旧案虽存，亦当煆之以拔其根，尚何追究其有无哉！
所谓“亦当煆之以拔其根”，就是应该烧掉，以断绝皇帝的这种下西洋的想法。当时，明宪宗想要消防明成祖朱棣，所以就让兵部找资料，做准备下西洋的准备。然而，刘大夏认为下西洋耗资无数，于国无益，所以就“毁掉”了这些资料。
后来，很多人都认同这一点，连明朝人也这么看。万历时期的顾起元，在《客座赘语》中记载（但作者又自称，本书荒诞不经），就将矛头指向了刘大夏。到了近代，有更多的人认同刘大夏毁掉资料，比如现代历史学家黄仁宇在其《中国大历史》中写道：
郑和之后再未有派遣舰队之事，船员被遣散，船只任之搁置废烂，航海图被兵部尚书刘大夏焚毁。
刘大夏有作案动机，但有没有胆量呢？当时，刘大夏相当于国防部副部长的职务（车驾司郎中），对兵部条文应该很清楚，按照明朝管理规范，刘大夏这一行为罪行当斩。更诡异的是，一年之后，刘大夏升任兵部尚书。
《大明律》明文规定：凡弃毁制书及起马御宝圣旨，起船符验，若各衙门印信及夜巡铜牌者，斩！若毁弃官文书者，杖一百！
不过，明朝文人胆子都比较大，一言不合就骂皇帝，所以姑且认为刘大夏胆子大，敢于顶风作案知法犯法，最后还能瞒天过海，以至于把皇帝都蒙蔽了。
然而，真的假不了，假的真不了。几十年之后，刘大夏有没有烧毁的郑和下西洋档案资料，却一本奇书给揭开了真相。
嘉靖年间，有一个叫茅坤的官员，职务也是车驾司郎中，他正在编写一本叫《武备志》的书时，就曾查阅过《郑和出使水程》（郑和下西洋的档案，主要就是这本书）。如今还能看到，这本书中就收录有《郑和航海图》——世界上现存最早的航海图集。
显然，刘大夏没有毁掉资料，可能是藏匿了起来，后来又放了回去，不然茅坤如何能看到《郑和出使水程》等资料？有学者感慨，难怪不是刘大夏，《武备志》清楚的给出了真相。
值得一提的是，《武备志》（乾隆时期成为禁书）是一本奇书，堪称“中国古代军事学的百科全书”，虽然知名度不算高，但却记载了从春秋到明代兵学的各个方面。这本书不属于原创，但却是茅坤、茅国缙、茅元仪祖孙三代接力编修整理而出，全书一共有240万字。
既然刘大夏不是真凶，那么谁是罪魁祸首呢？有学者还提出一个看法，就是明末清初，由于战乱频发，可能这一批资料在乱军之中被毁掉了。
但这一观点，还是经不起推敲，原因很简单：南京图书馆古籍部现存的《明史稿》中，就有不少郑和下西洋舰队规模、线路、以及技术装备等的描述。在《明史》定稿之后，郑和下西洋的描述，全部被删除了。
还有一个关键在于，《明史稿》中记载的下西洋内容，在明朝其他史书上没有。由此可以推断：清朝时期，《郑和出使水程》还在。
清朝乾隆年间的《敕封天后志》一书中，记载了永乐二十二年（1424年）郑和率船队出使苏门答腊旧港。但在如今正规史书中，却认为这一年下西洋是“停摆”。后来考古发现，这一记载是正确的。乾隆年间的这本书，如何知道300多年前的事？答案一目了然。
联系到乾隆在《明史》定稿之后，就将1000多万份明朝官方档案销毁，只留下3000多份明朝中后期的资料，就很能说明郑和下西洋资料去向了。后来，在编修《四库全书》时，毁掉的存目（四库全书中记载被毁掉书籍的书名）和不存目书籍不计其数。
比如，《四库全书》存书仅仅3475部、79070卷，但存目焚毁6766部、93556 卷，毁掉的比保存的还要多，《四库全书》收录的书籍中，还不确定被删改了多少。
从乾隆之后，就再也没有郑和下西洋的资料流出，说明乾隆才是毁掉档案资料的罪魁祸首。或许，乾隆自己都没注意，随手一勾，《郑和出使水程》就和无数明朝资料被销毁了。
乾隆的这一举动，给后人带来了很多困惑，也让中国历史变得模糊起来。郑和下西洋的真相难觅，只是乾隆带来的麻烦之一，在《明史》中还有很多问题，无数原始资料被毁，如今很难确定明史记载的准确性，明朝虽然离我们不远，但现代人却始终难以看清。正因如此，所以有学者研究之后感慨：乾隆不愧是历史毁灭者！
所谓“欲灭其国，先灭其史，欲灭其史，先乱人心，欲乱人心，毁其太祖”，乾隆是一个高明的权谋者！
