元朝是第一个统一的少数民族政权，而且是由蒙古帝国演变而来的，所以起兵自然是在大漠，也就是今天的外蒙古地区，它起初的国都是在哈拉和林，今蒙古国中部的额尔德尼昭，位于乌兰巴托东北部。如果在往前推移，成吉思汗时期，大斡耳朵就是其真正国都，还是在蒙古国东部富饶地带，沿着克鲁伦河和肯特山之间，这是蒙元的发祥地，也就是说元太祖铁木真的起事之地，那也曾是其最初部落蒙古乞颜部的领地。
所以蒙古帝国在鼎盛时期，中央核心一直在蒙古高原中部，也就是克鲁伦河和鄂尔浑河之间，要说后来为什么在上都或者大都，那是忽必烈元朝的事，也就得说蒙古变成元朝是渐渐向中原倾向，这个时候，帝国早已分裂为四大汗国。尤其西方的金帐汗国，伊尔汗国，察合台汗国已与蒙元中央形成对立，不再去漠北哈拉和林听从大汗安排，开会讨论开拓疆域和处理政务事宜，所以忽必烈把精力直接放在中原，无心管西域的事。也并不是说元朝不想迁都西安，他们也明白过去的长安是鼎盛时期汉唐帝都，但相对于中原王朝而言，也就是汉族政权，他们往往会想到自己就是匈奴，鲜卑，突厥。
现在北方少数民族蒙古族也就是自己强大了，自然会把自己的地盘看得重要而且地位方面不言而喻，所以没必要迁都长安，恢复汉唐盛世，因为成吉思汗本人也称况我单于国千百年之未有，也就是说以匈奴为骄傲，所以他们不像辽金不愿一时迁都中原，即便1215年，成吉思汗攻打金国中都看这里繁华，早已就迁都，可最终没有，只抢掠后北归，运回蒙古而已。
而相比说长安更不值一提，那时长安之名早已不存在，在唐末失去了帝都之后，被朱温拆迁的不成样子，经历五代，宋，变成京兆，城市缩得只有皇朝大小，一段时间还作为忽必烈封地，但只作为治理中原的一个据点而已。所以长安已败落，那时王朝像宋朝这样大国根本就没有考虑迁都长安，由于受西北威胁较大，而把国都重心移到河南开封，洛阳。
至于元朝为什么不考虑迁都长安，自然也有其理由，除了上述以外还有其建都想离家乡比较近，开始由东部大斡耳朵往西迁到哈拉和林，最后往东南倾向迁位于内蒙古正蓝旗，接着就是燕京。毕竟燕京是辽金国都已经有很长时间影响力，尤其是金国，一直是控制北方的重镇，离东北和漠北比较近，直通西域，所以燕京是必选，那时对于蒙元崛起从成吉思汗时代到忽必烈时代，燕京一直是他们心中中原地位最重要的地方，蒙古帝国时代设有燕京行尚书省，控制黄河以北地区，接由断事官管辖，所以它作为以后蒙元帝都不足为奇，而相比于长安失去地位同时，早已没落。
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