宁远之战，后金久攻不克，损兵折将达一二千人之多，损失是很重的。对于后金来说，更不幸的是，战后八个月，努尔哈赤又突然溘世。
对于努尔哈赤的死，历来是众说不一。或云：经不住宁远战败的惨重打击，使这位所向无敌的英明汗抑郁成疾而终。但也有其它各种说法。滕绍箴认为，在宁远激战中，“努尔哈赤正在奋力督战时，突然被炮火击中，受了重伤。”由于“战败受伤，郁闷成疾，导致身亡。”（《努尔哈赤评传》）就是说，努尔哈赤死于炮伤，不愈而亡。
周远廉、赵世瑜在《皇父摄政王多尔衮全传》一书中则认为，努尔哈赤死于“忧忿成疾”、“创伤未愈”及“痈疽突发”的合并症。
他们说：“本年（1626）正月进攻宁远失利，努尔哈赤负伤撤围回兵以后，因征战40年，所向无敌，而独败于孤城宁远之下，十分气愤，忧怒成疾，创伤未愈，又痈疽突发，于七月二十三日，往清河汤泉沐养……但毫无成效，病势越益严重……十一月未刻在瑷鸡堡去世，享年六十八岁。”
与上述诸说不同，《明清战争史略》则认为，努尔哈赤死于痈疽，而非炮伤所致。炮伤之说，源于《春波堂日月录》，该书“独载努尔哈赤被炮击成重伤，不久即因伤重而亡。”此说不可靠。这是因为：“朝鲜人韩瑗虽身在宁远城中，目睹了激战实况，但他所看到的，也只是远距离的模糊印象。当时，传闻很多，诸如努尔哈赤受伤亦在传闻之中。故该官回朝鲜后，将传闻写成了真事。”“从明朝当事人的奏疏、报告中，也都看不到努尔哈赤受伤的任何反映。只有毛文龙在奏疏中称：他听到‘回乡的张有库等人说，新年老罕王于二十四日在宁远等处攻城，不料著伤技……”，这也不过是传闻，没有可靠的根据。
实际上，努尔哈赤败退沈阳后，于四月初四日，还亲自统率诸贝勒、大臣征伐蒙古，至五月初才班师回营，再过三个多月才去世。若是被炮重伤，何以能统兵亲征？
指挥宁远战役的袁崇焕证实：他得到了可靠情报，“皆云奴酋耻宁远之败，遂蓄愠患疽，死于八月初十日。”其后，御史汪若极进一步确认，在宁远城下，“奴焰大挫，一旦疽发而伏天诛。”
很清楚，努尔哈赤患有不治之症的痈疽。宁远城下的惨败给他精神带来的沉重打击，使他气愤、抑郁，以至得痈疽病。甚至可以说是痈疽急剧爆发的一个诱因，而气愤抑郁导致情志不舒，使病情加剧而不可复治。可以说，努尔哈赤之死，绝非炮伤所致（因为他没有被炮所伤），而是无情的痈疽夺去了他的生命。
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