1925年10月10日，故宫博物院成立。溥仪走了，带走能带走的，带不走的就成了有些人眼中的肥肉。1927年1月8日，北洋政府开始变卖故宫不易长期存放的消耗品，如食品、药材、茶叶、洋烟、洋酒、皮货、绸缎等。1928年10月，国府委员经亨颐提出“废除故宫博物院，分别拍卖或移置故宫一切物品”，并提出五个论点：故宫博物院名义不通；办院是为了做皇帝者的准备；博物院不应据有图书与文献；逆产应当拍卖；保管不善难免以伪换真，使“保管”变为“保完”的黑手。这一提案竟然被顺利接受，一时舆论大哗。此事之后故宫博物院虽未停办，拍卖却一直继续。1932年2月，拍卖不仅处理了永寿宫的银锭和金砂，还变卖了一些文物、贡品。
金银被拍卖，档案竟也难逃。王国维曾作《库书楼记》，详细记述罗振玉发现内阁大库档案的流失和收购经过。清朝二百多年，宫廷公文档案堆积如山，都集中收藏于内阁大库。1909年内务府修缮内阁库房，将年代近一些的档案搬移到文华殿，而准备将年代久远的档案予以销毁。时任学部大臣的张之洞和在学部供职的罗振玉建议将所有档案移交学部图书馆收藏，此后搬运了一部分到国子监，仍有大批档案留在内阁大库，直到清朝灭亡。1912 年，民国政府在国子监成立历史博物馆筹备处，以内阁档案作为藏品，后来筹备处迁到紫禁城午门城楼，又将内阁档案从国子监搬移到午门外朝房和端门的门洞里。如此波折，自然有不少文献损失散佚。
1921 年，教育部为筹发历史博物馆职员薪金，将大部分档案装成八千多麻袋( 一说是九千多袋) ，按废纸价格卖给西单牌楼北大街的“同懋增”纸品店。1922 年 3 月，曾入职小朝廷的罗振玉在北京书肆发现洪承畴的《洪文襄揭帖》和朝鲜国王贡品表，立刻察觉到它们的价值。得知这些文献来自内阁大库，由当时的历史博物馆出售给废纸商人，他追踪找到纸品店，以高价悉数买下。罗振玉曾打算筑楼以收藏这批难以计数的档案，但由于财力原因，未能如愿。不久，他将这批档案卖给藏书家李盛铎。1928 年，北平历史语言研究所作价从李盛铎处将内阁档案收购，才最终将其归属国有。
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