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关于这个问题有两本书中分别有不同的说法，一本是《封神演义》中三清是老子一气化的三清；而在《西游记》中明确提到三清就是指元始天尊、灵宝道君、太上老君。
一、《封神演义》中关于三清的描述从两本书中讲述故事的时间来看，似乎《封神演义》就是《西游记》的前传，确实《封神演义》是讲商周朝代交替为时间背景，而《西游记》故事时间背景是唐朝初期，但两本书关于神仙的描写有些不同。
太上老君一气化三清出现在通天教主设立诛仙阵，太上老君亲自试阵的时候，与通天教主在陷仙门大战时候发生的事，太上老君要显手段给截教门人看。书中写到把青牛一拎，跳出战圈，把鱼尾冠以推，顶上三道气出，化为三清，一位是上清道人，一位是玉清道人，一位是太清道人。三位道人加上太上老君一起来战通天教主，这个一气化的三清，只是元气化形，虽然有形有色，裹住了通天教主，但也伤不得他。通天教主也不认识一气化三清的玄妙。
二、《西游记》中关于三清的描述在《西游记》中在车迟国孙悟空三师兄弟偷三清的贡品吃，孙悟空给猪八戒讲了三清为元始天尊、灵宝道君、太上老君。三师兄弟除了偷东西吃外，猪八戒还把三清的圣像丢到了粪坑中去了。他们化作三清像捉弄虎鹿羊三仙，撒尿充当圣水。
《西游记》中的三清与《封神演义》中的三清完全是两回事。
三、道教历史上关于三清的争执在道教历史上，在魏晋三国时期，道教的神仙就已经非常杂乱了，陶弘景编写《真灵业位图》，试图把中国道教的各路神仙体系归位在一起，但却不能让很多道教门派信服，指责这本书神谱乃是上清派的一家之词。各道教门派对于道门的最高神仙彼此不完全认同，直到南北朝的时候，道门各派才统一接受了元始天尊、灵宝天尊、道德天尊为道教最高神位的说法，道教的神仙谱系才最终定型。
虽然道门各派接受了三清为最高神位，但是谁才是创始神后世还有很多争议。普遍认为太上老君才是道门的创世神，三清之一的灵宝天尊也饱受争议，因为此人名声不显，不知道此人有什么能耐和功绩能够座上宝座；而且太上老君座次派在第三，前两位有何德何能居其上？
综合以上分析，虽然两本书的成书时间都是在明代中后期，但很明显，两位作者对于三清的描写分别采取了道门不同流派的说法。在目前，笔者还是认为三清是元始天尊、灵宝道君、太上老君这种说法占主流。
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