首先，需要说的是“阉党”是包括投靠魏忠贤的文臣。其次，两者当然有本质区别的，东林党毕竟以儒家思想为基础，其内部文化、文学氛围较为浓厚，且相对更清廉。最后，“东林”被扩大化了，有些人甚至把阉党文臣放入东林文臣内。
（1）“东林”和“阉党”内部都有能人
东林党是有思想文化的、有一定治国带军能力的人的松散集团，而且许多人都有一定的治国带军才能，例如叶向高、赵南星、孙承宗等。同时，也夹杂着不少能力不高、只会喊叫的人。
阉党除了宦官外也有大批文臣。但是以魏忠贤的决心为核心。宦官是没有行政管理经验和能力的，靠的是崔呈秀、阎鸣泰、王洽、张凤翼等人去执行，这些人的人数要比“东林党”人数大得多。他们之所以加入“阉党”主要是因为贪腐、工作错误等被参劾或政治斗争失败。
（2）你是清流东林；尔为阉党太监，横批：二祸
前面是一位读者骂我的，主要是我经常说些“反腐”的话，对一些有才能的大贪官经常持批评态度。后面那句话和横批则是我回复该名读者的话。
“东林党”在天启朝无疑是起到正作用；但是消灭魏忠贤后，双方的“党争”带有很强的“意气”，所以，他们在崇祯朝都是“祸害”。
例如钱谦益就是“东林党”后期的领袖，但他除了诗词歌赋外，政治上能力不高、人品低下。
（3）“党争”只是明亡的原因之一
对于明朝灭亡的原因，许多人都将其归结为一点——党争。“阉党”造成的“祸”，主要是专权和以不合法、不合理、危害性更大的方式进入他们不懂的行政领域、军事领域，超脱了既定的司法侦查权领域，从皇权手中的工具变成了皇帝本身。
本来，太监通过制衡文官的行政系统、“厂卫特务统治”掌控司法侦查权、“镇守太监”监视军事系统，从皇权内部划出一部分权力用以“代替”皇帝监视文武。但他们从未管理过国家，管理国家的仍然是文官系统。但万历之后，这一传统被打破，“矿监”地出现本身就是乱象开始。
（4）大明亡国并非仅仅“党争”，它是“综合原因”导致而非一点
国家的失败和灭亡，很难有一种原因、一个因素。例如外戚专权？西汉、东汉立国前后四百余年，期间外戚专权就达三百多年。
如此等等不一而足，大朝代不会因为一个问题没搞好而灭亡的，只能是综合性原因。
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